222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1487 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
127 aa  248  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  71.19 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  51.72 
 
 
123 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.35 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  42.15 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.66 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  37.72 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  30.17 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  40.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  43.2 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  41.23 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  36.04 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.83 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  38.6 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  40.34 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  44.74 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  44.74 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  44.74 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  45.16 
 
 
230 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  45.16 
 
 
230 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  45.16 
 
 
230 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  36.52 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  41.38 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.01 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.02 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  39.32 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  39.83 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  41.88 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.09 
 
 
227 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  39.83 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  44.09 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  41.74 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  45.05 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  43.01 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  36.84 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  41.59 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  38.46 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  37.6 
 
 
230 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.34 
 
 
212 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.26 
 
 
229 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  41.94 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.65 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.15 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.52 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  39.64 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  35.65 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  42.98 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.21 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  39.52 
 
 
227 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  37.17 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  34.13 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.9 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  41.76 
 
 
236 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  41.76 
 
 
227 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  40.22 
 
 
255 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  37.12 
 
 
239 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.86 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  35.77 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  34.78 
 
 
238 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.47 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.62 
 
 
229 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  37.39 
 
 
231 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.39 
 
 
231 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.61 
 
 
224 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.9 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.36 
 
 
213 aa  60.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.78 
 
 
233 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.43 
 
 
236 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.05 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.56 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.66 
 
 
238 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  35.54 
 
 
210 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.3 
 
 
232 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.05 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 
239 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 
234 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>