210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1495 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
138 aa  273  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  71.19 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  55.75 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.97 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.37 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.6 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  35.45 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  42.06 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  41.12 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  41.12 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  30.43 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.21 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.62 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  39.05 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  40.17 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.19 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  36.36 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  35.88 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.59 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.61 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.13 
 
 
153 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  32.5 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  33.59 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  36.45 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  33.33 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  37.61 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  36.75 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  36.04 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  37.61 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.65 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.17 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  37.72 
 
 
226 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  37.5 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.96 
 
 
221 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.39 
 
 
230 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.48 
 
 
212 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 
247 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.04 
 
 
239 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  37.61 
 
 
240 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  33.06 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 
231 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
218 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  27.97 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.03 
 
 
225 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.96 
 
 
240 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  34.51 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  36.54 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.23 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.86 
 
 
231 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  37.86 
 
 
231 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.93 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  34.45 
 
 
164 aa  58.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33.82 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 
227 aa  57.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36.52 
 
 
227 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  36.19 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  37.19 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  33.61 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  40.22 
 
 
231 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
232 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
235 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  28.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.16 
 
 
239 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  34.71 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.92 
 
 
241 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  31.15 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  28.33 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.08 
 
 
223 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  32.23 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>