183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0318 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  100 
 
 
123 aa  238  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.75 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.72 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 
126 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  34.48 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  42.34 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  37.5 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  36.7 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.34 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.26 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  36.7 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  36.11 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.66 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  31.67 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  36.45 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  32.14 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  38.14 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  37.38 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.78 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.09 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  40.35 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  36.52 
 
 
255 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  35.65 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  33.93 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.41 
 
 
238 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  37.07 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  37.07 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  32.73 
 
 
213 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  37.07 
 
 
244 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.74 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.35 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  39.62 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  30.17 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  37.07 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  33.05 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  30.17 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  37.72 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  37.93 
 
 
231 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 
230 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  35.34 
 
 
230 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  32.2 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  35.34 
 
 
230 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.93 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  33.61 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.84 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  32.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  33.04 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  32.73 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  32.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  32.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  32.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
231 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  29.31 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  32.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  42.59 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.04 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  34.48 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  30.28 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  25.69 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  38.1 
 
 
218 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  38.39 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.27 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  34.48 
 
 
230 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  34.48 
 
 
229 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  31.43 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  33.61 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  35.51 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.39 
 
 
225 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  33.05 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.58 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  34.48 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  29.06 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  22.61 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>