229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  300  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.67 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  57.03 
 
 		 134 aa  144  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.41 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  41.6 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.15 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.29 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.32 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  36.52 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 168 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.07 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.29 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.6 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  42.34 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  36.89 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  35.29 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.26 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.13 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.13 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.09 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.13 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35.58 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  34.81 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  31.58 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  31.58 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  34.59 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  31.58 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  36.15 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  36.13 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  34.21 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  36.67 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  32.77 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.38 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.36 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  40.87 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  35.96 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  31.09 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  35.09 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.52 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  33.62 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.98 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  30 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  32.2 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.64 
 
 		 237 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  32.31 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  34.4 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.17 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  37.07 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  35.45 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  31.15 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  31.3 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  28.33 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.55 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  32.09 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.92 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  36.28 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  34.75 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  34.75 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.71 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.9 
 
 		 227 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  39.09 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  33.9 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.4 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  38.26 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  28.93 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  33.64 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  31.71 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  34.58 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  28.81 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>