181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1636 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 160 aa  336  8e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  56.25 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  55.22 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  52.14 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  51.8 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  42.45 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.01 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.82 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.65 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.4 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.15 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.3 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 240 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.93 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.21 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.04 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  27.87 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  44.93 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  32.61 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.52 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  33.94 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.45 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.17 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.31 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  27.35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  28.45 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  29.91 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.86 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.35 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.1 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.57 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.89 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 229 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.5 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.19 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 236 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  33.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  28 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.28 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  29.31 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.32 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.65 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  29.31 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.04 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.04 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  29.5 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  26.23 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.83 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  40.51 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  30.84 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  28.97 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.97 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  29.29 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.61 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  27.1 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  26.67 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  26.32 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  33.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  30.09 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  30.63 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  30.09 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>