179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0817 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.8 
 
 		 160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  49.63 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  49.25 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  42.03 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  44.29 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36.07 
 
 		 227 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.35 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.78 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  28.35 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.61 
 
 		 234 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.76 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  35.25 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.33 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.88 
 
 		 239 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  30.83 
 
 		 217 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.87 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.91 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.89 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.4 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.89 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.97 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  29.06 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  29.13 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.5 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.46 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.21 
 
 		 239 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.04 
 
 		 237 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.16 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.92 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  34.04 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  34.04 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.29 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  29.59 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.51 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.84 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  29.84 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.84 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.92 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.69 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  29.17 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  29.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  34.29 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  34.29 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  28.07 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  34.29 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  28.33 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.94 
 
 		 227 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  28.33 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.51 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.98 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.92 
 
 		 220 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  27.69 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  27.69 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  27.69 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.69 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  29.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  27.91 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.47 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  34.91 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.04 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.25 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  31.73 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  32.32 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.48 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  35.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  35.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  29.51 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  35.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  35.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  35.23 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  31.11 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>