213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0113 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.23 
 
 		 225 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 239 aa  84.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.68 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.96 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 		 218 aa  80.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.51 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.92 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  31.62 
 
 		 219 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  32.33 
 
 		 224 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  37.01 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  34.56 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  33.09 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  38.1 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  29.46 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.23 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  31.82 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.61 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  26.67 
 
 		 408 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  29.46 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.99 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.84 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.51 
 
 		 220 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.8 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.13 
 
 		 221 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.66 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.07 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  30.15 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.11 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.15 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.16 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  35.16 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  33.09 
 
 		 214 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  32.85 
 
 		 214 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.58 
 
 		 227 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  36.22 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.37 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  34.04 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.35 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  35.94 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  34.13 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.59 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.13 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.86 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  31.75 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.16 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  35.2 
 
 		 240 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.23 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  34.13 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  32.8 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  29.1 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  29.69 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.91 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.2 
 
 		 234 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  31.75 
 
 		 255 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.03 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  32.09 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.69 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  31.2 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31.2 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  32.35 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.03 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.03 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.25 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.03 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.54 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  32 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  30.88 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  30.65 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  27.42 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.59 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>