89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1784 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  45.64 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  41.5 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0316  iron dependent repressor  40.14 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.29 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.61 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  27.03 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  27.7 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  29.85 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  31.09 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  27.7 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  27.89 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  32.41 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.83 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  25.18 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.53 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  26.76 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  30.77 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  25.32 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  23.78 
 
 		 248 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.89 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  36.23 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  24.39 
 
 		 228 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  20.9 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  25 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  21.88 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  22.37 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  23.17 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  23.17 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  20.9 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  23.13 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.36 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  23.17 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.5 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.2 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  36 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  24.8 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.43 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.32 
 
 		 240 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  21.28 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  23.19 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  25.81 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  25.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.27 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.34 
 
 		 209 aa  44.3  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  23.47 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.75 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  30.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  24.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.95 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  24.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  24.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  24.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  22.22 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  24.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  21.14 
 
 		 233 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.4 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.89 
 
 		 224 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  25.55 
 
 		 148 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.18 
 
 		 121 aa  42  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1198  iron dependent repressor  38.46 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  29.35 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  29.41 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  21.95 
 
 		 241 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.27 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  25.78 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  21.26 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  25.62 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.21 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  22.73 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  32.26 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  21.14 
 
 		 236 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>