185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1198 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1198  iron dependent repressor  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  57.48 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  30.17 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0335  iron dependent repressor  58.33 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.127848  decreased coverage  0.00440763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.48 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  31.9 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  31.36 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.01 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  32.17 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.34 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  34.96 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  26.5 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  38.89 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  34.48 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.09 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.7 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.58 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.26 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  34.45 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  31.71 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  33.61 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.46 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.83 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.07 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  33.93 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  29.91 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.18 
 
 		 227 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  27.69 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.17 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.19 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  32.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.46 
 
 		 234 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  33.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  35.85 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  35.05 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.58 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  32.58 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.58 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  33.06 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  33.06 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.97 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  28.85 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  29.6 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  35.35 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  28.81 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.64 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  30.91 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  30.4 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  30.48 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  31.31 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  32.99 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  27.5 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.45 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  31.13 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  28.44 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  28.44 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  25.71 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  37.7 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  33.06 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.6 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.55 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.19 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  32.89 
 
 		 390 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  35.05 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>