175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0171 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 146 aa  296  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  76.26 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  74.82 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  74.29 
 
 		 145 aa  209  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  73.91 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.99 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  38.71 
 
 		 221 aa  80.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.76 
 
 		 240 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  36.52 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.14 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36.44 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.71 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  39.66 
 
 		 222 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  37.78 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.08 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.07 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  39.64 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.29 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  38.74 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  38.74 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  38.74 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  38.74 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.62 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  37.61 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.45 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.48 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  36.22 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.04 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.4 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  35.48 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.4 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.4 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.44 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  34.15 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  36.94 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0711  iron dependent repressor  34.45 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.81 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.82 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2024  iron dependent repressor  34.51 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  36.94 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.11 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.93 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.17 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  32.39 
 
 		 217 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.54 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  34.13 
 
 		 217 aa  62  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.66 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.78 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  29.5 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.77 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  29.01 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.86 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.7 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.33 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  33.9 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  26.72 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  33.9 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.28 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  27.61 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.33 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  26.89 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  30.08 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  34.68 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  28.24 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  33.98 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.45 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  32.35 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.83 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.46 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.96 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  30.3 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.86 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  30.89 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.54 
 
 		 229 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  39.47 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  29.03 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  27.69 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.66 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.68 
 
 		 236 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  33.64 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>