134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3271 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2024  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.29 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  41 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.24 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.68 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.31 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  36.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.01 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  39.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  39.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  39.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.7 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  39.08 
 
 		 248 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  36.22 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.75 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  32.81 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  40.26 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  36.8 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.04 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  31.68 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  37.23 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  32 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  37.93 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.79 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  33.72 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  36.25 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  36.25 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.75 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.74 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  46.43 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.15 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 240 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36 
 
 		 230 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.19 
 
 		 236 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.16 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.51 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  36.51 
 
 		 240 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  33.71 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.18 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  35.23 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.21 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  32.43 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  38.36 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  39.39 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  36.78 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  26.45 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  27.05 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  29.1 
 
 		 218 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  40.28 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.47 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.78 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.63 
 
 		 235 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  30.84 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  26.8 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.14 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0711  iron dependent repressor  29.41 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.72 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  36.92 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.94 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  31.52 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  32.53 
 
 		 238 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  38.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.06 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.18 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.82 
 
 		 219 aa  43.9  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  34.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32.26 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  40.68 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.33 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  29.91 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.37 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>