92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0133 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  100 
 
 		 174 aa  353  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  45.64 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0316  iron dependent repressor  50.82 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  50 
 
 		 151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  27.94 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  27.89 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.88 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  28.97 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.49 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.43 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.41 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  26.95 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.28 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  32.08 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  28.15 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  29.69 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  26.55 
 
 		 226 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  27.43 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.28 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  25.2 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  28.44 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.95 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.9 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  35.37 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  26.09 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  26.5 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.9 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  25.93 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  30.51 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  27.05 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 121 aa  47.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.17 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  23.13 
 
 		 234 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  37.68 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  27.21 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  25.49 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.11 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.18 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  27.83 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  26.85 
 
 		 238 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  23.93 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  23.93 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  26.5 
 
 		 127 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  31.82 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.35 
 
 		 225 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  25.42 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.68 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  30.28 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  23.28 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  29.82 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  24 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  27.27 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  24.79 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  26.37 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  25.49 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  30.36 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  27.27 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  25.45 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  27.96 
 
 		 270 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  22.22 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.95 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.59 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  27.19 
 
 		 217 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 144 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1198  iron dependent repressor  47.62 
 
 		 136 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  27.12 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  25.74 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.66 
 
 		 145 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  26.36 
 
 		 134 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 		 172 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.66 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.66 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  25.66 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.19 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.27 
 
 		 240 aa  40.8  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>