133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0156 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  52.76 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  45.1 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  34.48 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  35 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  40 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.93 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  47.83 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  35 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.13 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  43.08 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  32.37 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.43 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  27.89 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  31.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  31.9 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  37.68 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  42.25 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  40.58 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  26.89 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  37.63 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  37.68 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  26.76 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  30.25 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.46 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.43 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  36.56 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.36 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  40 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  30.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  41.18 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  29.36 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  38.24 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  37.36 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  27.97 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.2 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.24 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  38.81 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  28.1 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 121 aa  52.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.89 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  39.06 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  43.55 
 
 		 72 aa  51.2  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.12 
 
 		 240 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  28.83 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  37.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.97 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  32.74 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.56 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.83 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  26.73 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.83 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 232 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.53 
 
 		 234 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  28.87 
 
 		 251 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.7 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  37.66 
 
 		 390 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  24.32 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.36 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.67 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.43 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  25.96 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.87 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  23.93 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  27.96 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  27.27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  24.32 
 
 		 240 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  24.32 
 
 		 240 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  24.32 
 
 		 240 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  23.64 
 
 		 242 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  25 
 
 		 237 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.74 
 
 		 227 aa  44.3  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  26.27 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  25.23 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  25.23 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>