60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0334 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0316  iron dependent repressor  96.03 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  50.41 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  41.5 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  34.46 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.93 
 
 		 231 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  30.95 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.81 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.03 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.47 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  30.58 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.47 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  25.38 
 
 		 236 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  27.07 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.47 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.06 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.67 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  29.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  32.11 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  24.62 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  31.86 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  27.73 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  27.59 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.41 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  36.11 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.15 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  29.32 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  26.56 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.72 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  30.47 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.52 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.22 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.25 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  27.34 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  26.67 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.13 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.95 
 
 		 226 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.34 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  27.42 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  27.18 
 
 		 218 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  23.2 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  23.48 
 
 		 223 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  24.6 
 
 		 210 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  25.19 
 
 		 142 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  25.93 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  26.5 
 
 		 238 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.77 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  27.34 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  25.2 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  30.23 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  24.43 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.41 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  24.6 
 
 		 232 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  26.43 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>