55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0316 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0316  iron dependent repressor  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  96.03 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  51.24 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  40.14 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  33.78 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.94 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  29.93 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.03 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  26.27 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.74 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  26.15 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  29.17 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.2 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.47 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  25.38 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  28.1 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  26.32 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.06 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  26.72 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  30.09 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  26.56 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  35.29 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  33.33 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.35 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  26.61 
 
 		 223 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  25.95 
 
 		 218 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.77 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.34 
 
 		 232 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  26.56 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  27.07 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  28.91 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  28.89 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  24.41 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  25.19 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  23.81 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  25.61 
 
 		 242 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.43 
 
 		 225 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.81 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  25 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  28.16 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  28 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  25.78 
 
 		 232 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  26.56 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.66 
 
 		 226 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.85 
 
 		 121 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>