117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0146 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  52.76 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  42.38 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  31.5 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  31.67 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32.84 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  35.07 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  28.99 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  32.76 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.01 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.74 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  29.75 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  32 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.09 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.16 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  28.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  28.81 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.36 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.06 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  30.28 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  29.92 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  43.28 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  27.14 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.09 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.06 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  35.87 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 121 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  27.94 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  25 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.36 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  25.2 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  32.14 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.14 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.41 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  31.37 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  29.55 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  32.04 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  36.47 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.82 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  30.09 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  39.68 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  29.41 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  29.36 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  26.72 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36 
 
 		 240 aa  44.7  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  34.31 
 
 		 226 aa  44.3  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  32.53 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  32.95 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  28.32 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  28.32 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.89 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.79 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  29.81 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  32.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.04 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.06 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  35.09 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  29.67 
 
 		 240 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  45.24 
 
 		 251 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 		 153 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  36.9 
 
 		 154 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  27.68 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>