112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2024 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2024  iron dependent repressor  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.07 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.81 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.02 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  29.31 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30.53 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30.53 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30.53 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  39.51 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.15 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.91 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.58 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.4 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.35 
 
 		 237 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.71 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  25.87 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  39.73 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  27.27 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  38.16 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  37.5 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  33.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.73 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.24 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.48 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.31 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 221 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.26 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.96 
 
 		 240 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.08 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  32.56 
 
 		 228 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.57 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  32.63 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.56 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  34.94 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  26.43 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  28.57 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  41.07 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  34.94 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.76 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.26 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.04 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  27.27 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  29.21 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 220 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.89 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0711  iron dependent repressor  30.49 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  32.88 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  24.44 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.94 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  31.76 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  41.27 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  32.88 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  32.88 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  31.88 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  31.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  35.82 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  34.43 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  34.94 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.32 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.69 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>