188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0381 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  77.62 
 
 
143 aa  228  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  74.82 
 
 
146 aa  212  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  72.99 
 
 
143 aa  209  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  71.32 
 
 
145 aa  200  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.57 
 
 
149 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  43.55 
 
 
222 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  38.02 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.07 
 
 
237 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.83 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.23 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  34.51 
 
 
217 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
214 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.8 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.15 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.89 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  36.13 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  35.54 
 
 
240 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  35.54 
 
 
240 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  35.54 
 
 
240 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.16 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  33.91 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3271  iron dependent repressor  37.4 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.16 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.16 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 
227 aa  72  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.09 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.82 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  32.59 
 
 
217 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.97 
 
 
225 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.44 
 
 
219 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.15 
 
 
240 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.71 
 
 
228 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.15 
 
 
230 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.15 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  34.09 
 
 
235 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 
218 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.37 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  34.15 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.67 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  34.71 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.67 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  32.82 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.13 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  35.9 
 
 
270 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  35.25 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.19 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.31 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 
238 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0711  iron dependent repressor  34.45 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  31.82 
 
 
220 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  33.59 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.15 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.01 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  35 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.08 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35.16 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.29 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.17 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36 
 
 
238 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  29.41 
 
 
237 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.52 
 
 
222 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.5 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  29.17 
 
 
236 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  32.86 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 
233 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.71 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.81 
 
 
239 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.81 
 
 
236 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36 
 
 
240 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 
234 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.62 
 
 
237 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  35.2 
 
 
228 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.08 
 
 
221 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.79 
 
 
229 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2024  iron dependent repressor  33.81 
 
 
159 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  30.83 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  30.83 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  27.64 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  32.5 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.4 
 
 
236 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 
229 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  32.26 
 
 
236 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  35.2 
 
 
255 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 
234 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  32.8 
 
 
244 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 
224 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.78 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.66 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>