185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0972 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  77.78 
 
 		 73 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  67.14 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  72.06 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  67.12 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  63.89 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  61.11 
 
 		 73 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  66.18 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  54.67 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  51.43 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  51.95 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  54.29 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  52.86 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  54.29 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  47.95 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  50 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  52.86 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.43 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  51.95 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  44 
 
 		 848 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  50.72 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2724  FeoA family protein  51.39 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000395552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  48.72 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  45.71 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  50 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  50 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  52.24 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  50.7 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1656  FeoA family protein  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  hitchhiker  0.000120569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  45.07 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  50 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  48.61 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  47.83 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  47.44 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  38.96 
 
 		 784 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  44.29 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  47.83 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  49.32 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  50.72 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  47.14 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  48.57 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  43.06 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  44.29 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  51.39 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  47.14 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  45.71 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  46.48 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  42.25 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  42.25 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  41.43 
 
 		 785 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  42.86 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.54 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  39.13 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1554  FeoA family protein  37.68 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000033207  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  41.89 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  47.3 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  39.71 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  39.71 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  42.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  42.62 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  40.58 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  45.45 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0013  FeoA family protein  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  44.44 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  44.29 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  43.48 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  43.06 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  50.94 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0883  Fe2+ transport system protein A  37.14 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000745699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  45.45 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  45.45 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0318  FeoA family protein  43.55 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  40 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  38.36 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  43.28 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  39.13 
 
 		 829 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1621  FeoA family protein  38.89 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.453732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2327  FeoA family protein  39.68 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3837  FeoA family protein  35.71 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1450  FeoA family protein  41.79 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298241  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 844 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  38.03 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  37.14 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  37.5 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  40.58 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  34.78 
 
 		 310 aa  53.9  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  34.33 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  32.84 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  45.65 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  45.65 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2189  FeoA family protein  35.71 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000240833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  37.14 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>