174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1686 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  100 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  72.46 
 
 		 149 aa  191  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  66.67 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  61.39 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  59.42 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  51.41 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  45.95 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  51.45 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  50.34 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  50.34 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  45.89 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  50 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  47.59 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  50 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.82 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  49.23 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  49.23 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  45.21 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  48.51 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  48.51 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  45 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  52.03 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  45 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  42.66 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  45.31 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  33.81 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  31.16 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  31.82 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.19 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.39 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  36.27 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  37.25 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  36.27 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.14 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  32.43 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.07 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.96 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  33.66 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.56 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  35 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.9 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  27.93 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  29.46 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  26.79 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.4 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.21 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  30.09 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.83 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  41.98 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  30.7 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.46 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.65 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 123 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  30.09 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 239 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  34.09 
 
 		 270 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  31.37 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  29.46 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  37.11 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.09 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  40.74 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  29.82 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.27 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  37.04 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  27.78 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  31.36 
 
 		 223 aa  48.5  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.51 
 
 		 232 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  38.27 
 
 		 236 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.27 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>