25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2797 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 254 aa  490  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  69.92 
 
 		 259 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  67.58 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  48.62 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.47 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  49.4 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  41.02 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  37.7 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  39.68 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.82 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  35.29 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  37.35 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.35 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  36.96 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  37.05 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.95 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  26.91 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.09 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  27.09 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  26.29 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.24 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  29.59 
 
 		 439 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>