24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1606 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  90.33 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  86.94 
 
 		 269 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  78.79 
 
 		 266 aa  433  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  62.98 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.38 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  31.87 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  33.07 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  30.2 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  32.27 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.06 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  32.16 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  29.41 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  28.06 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.29 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  28.29 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  29.52 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  32.3 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.51 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  41.82 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>