26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1576 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  65.04 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  63.74 
 
 		 269 aa  364  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  63.64 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  58.56 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  52.55 
 
 		 263 aa  278  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.15 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  45.8 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.45 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  37.45 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  36.43 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  36.29 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  38.1 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  35.71 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.69 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  33.86 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  32.27 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  32.16 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.87 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.35 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.04 
 
 		 379 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>