26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1359 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  530  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  67.18 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  54.58 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  47.66 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.72 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  48.26 
 
 		 266 aa  254  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  49.22 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  47.27 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  45.88 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.54 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  40.54 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  37.98 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  39.38 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.61 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  34.63 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  34.39 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  34.38 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  34.39 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  33.2 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.41 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.38 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>