30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3448 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  94.5 
 
 		 203 aa  387  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  72.22 
 
 		 204 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  64.4 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  64.43 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  43.59 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  34.87 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 106 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  29.17 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  47.46 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  30.61 
 
 		 126 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  22.75 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.85 
 
 		 691 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  25.84 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  35.37 
 
 		 690 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  30 
 
 		 266 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 167 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 77 aa  42  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>