22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6307 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  100 
 
 
374 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  82.14 
 
 
363 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  61.62 
 
 
386 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  53.21 
 
 
365 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  49.29 
 
 
345 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  45.77 
 
 
355 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  44.53 
 
 
382 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  45.33 
 
 
348 aa  289  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  44.15 
 
 
360 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  49.45 
 
 
404 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  46.37 
 
 
379 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  46.39 
 
 
377 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  49.59 
 
 
358 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  39.16 
 
 
357 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  54.63 
 
 
206 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  37.97 
 
 
411 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  35.36 
 
 
316 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  37.38 
 
 
411 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  53.69 
 
 
159 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  43.72 
 
 
212 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9917  hypothetical protein  96.55 
 
 
50 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.62 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>