20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9513 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  53.21 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  53.57 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  48.64 
 
 		 355 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  46.2 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  51.45 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  47.81 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  48.45 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  44.92 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  45.12 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  45.09 
 
 		 377 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  49.86 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  44.09 
 
 		 404 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  40.67 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  51.31 
 
 		 206 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  37.22 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  36.86 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  55.92 
 
 		 159 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  46.56 
 
 		 212 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  32.09 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>