20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4505 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  77.93 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  50 
 
 		 374 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  48.68 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  47.24 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  46.24 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  48.2 
 
 		 379 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  49.44 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  49.09 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  51.08 
 
 		 357 aa  282  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  45.68 
 
 		 360 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  46.88 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  45.8 
 
 		 348 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  44.82 
 
 		 345 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  54 
 
 		 206 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  39.55 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  40.3 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  51.23 
 
 		 212 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  53.55 
 
 		 159 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  41.75 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>