27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0710 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  97.75 
 
 
348 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  76.82 
 
 
360 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  48.64 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  47.93 
 
 
386 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  48.26 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  45.77 
 
 
374 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  47.92 
 
 
363 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  45.12 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  44.47 
 
 
377 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  42.82 
 
 
382 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  47.37 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  45.53 
 
 
404 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  53.23 
 
 
206 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  40.33 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  37.91 
 
 
411 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  38.71 
 
 
316 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  36.9 
 
 
411 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  54.42 
 
 
159 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.53 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.63 
 
 
438 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.09 
 
 
384 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  26.26 
 
 
388 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  24.14 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.25 
 
 
412 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>