21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7169 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  100 
 
 		 379 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  89.97 
 
 		 377 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  58.97 
 
 		 382 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  46.6 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  45.12 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  45.12 
 
 		 355 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  46.91 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  46.77 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  44.06 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  42.89 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  48.17 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  49.32 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  46.28 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  41.19 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  49.76 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  35.18 
 
 		 411 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  49.39 
 
 		 212 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  53.29 
 
 		 159 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  40.76 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  34.92 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.33 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>