21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3777 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  50.13 
 
 
404 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  50.42 
 
 
358 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  41.19 
 
 
379 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  40.54 
 
 
377 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  38.62 
 
 
382 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  41.1 
 
 
386 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  39.69 
 
 
374 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  40.88 
 
 
363 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  40.67 
 
 
365 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  40.33 
 
 
355 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  40.22 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  38.42 
 
 
360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  37.5 
 
 
345 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  35.77 
 
 
411 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  41.9 
 
 
206 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  36.78 
 
 
411 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  34.4 
 
 
316 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  46.67 
 
 
159 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  40.26 
 
 
212 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  32.76 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>