20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4093 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  59.17 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  58.97 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  44.92 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  46.23 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  44.53 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  45.86 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  42.82 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  42.3 
 
 		 348 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  41.78 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  44.74 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  47.03 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  48.79 
 
 		 358 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  38.62 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  50.26 
 
 		 206 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  37.5 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  37 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  48.21 
 
 		 212 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  38.42 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  52.67 
 
 		 159 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>