21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6014 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  89.97 
 
 
379 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  100 
 
 
377 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  59.17 
 
 
382 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  45.09 
 
 
365 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  46.98 
 
 
386 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  44.47 
 
 
355 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  47.74 
 
 
345 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  43.42 
 
 
348 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  44.18 
 
 
360 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  46.39 
 
 
374 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  46.42 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  48.04 
 
 
404 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  48.76 
 
 
358 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  40.54 
 
 
357 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  49.52 
 
 
206 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  35.52 
 
 
411 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  54.97 
 
 
159 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  38.83 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  35.34 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 
438 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>