21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4289 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  36.07 
 
 		 360 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  39.52 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  35.36 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  35.29 
 
 		 363 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  38.71 
 
 		 355 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  33.06 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  32.52 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  32.09 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  33.88 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  34.4 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  38.42 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  37.37 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  40.31 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  41.75 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  34.47 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  40.31 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4417  hypothetical protein  36.81 
 
 		 212 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  40.72 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  45 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.84 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>