18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4395 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4395  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  55.92 
 
 
365 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6014  protein of unknown function DUF1612  54.97 
 
 
377 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434191  normal  0.0497439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7169  protein of unknown function DUF1612  53.29 
 
 
379 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929505  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  53.69 
 
 
374 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  70.97 
 
 
358 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0710  hypothetical protein  52.74 
 
 
355 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.813382  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0666  hypothetical protein  53.19 
 
 
348 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  50.66 
 
 
363 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3834  hypothetical protein  57.89 
 
 
360 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4093  hypothetical protein  52.67 
 
 
382 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  48.45 
 
 
386 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  67.86 
 
 
404 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5045  hypothetical protein  48.57 
 
 
345 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3777  hypothetical protein  46.67 
 
 
357 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8480  protein of unknown function DUF1612  40.91 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.473056  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7901  protein of unknown function DUF1612  41.9 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422696  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4289  hypothetical protein  45 
 
 
316 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.260981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>