More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2307 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  98.07 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  97.51 
 
 		 362 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  96.96 
 
 		 362 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  734    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  749    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  98.07 
 
 		 362 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  43.87 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  43.59 
 
 		 363 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  44.6 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  43.02 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  39.41 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  39.35 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  39.41 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  36.87 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  39.41 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  39.41 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  39.41 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  39.41 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  33.04 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  39.09 
 
 		 313 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  37.16 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  37.47 
 
 		 377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  30.83 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  32.01 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  29.08 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  28.76 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  30.38 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  25.92 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.04 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.02 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  27.94 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  23.15 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.52 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.33 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  25.93 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  28.76 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.67 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.1 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.69 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  26.04 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  26.92 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.24 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.58 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.35 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.32 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  28.14 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.98 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  26.17 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.52 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.35 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  23.66 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.45 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  23.66 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  23.68 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  23.66 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  24.82 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  24.82 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.05 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  23.13 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  22.8 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  24.82 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  26.17 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  23.28 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  23.47 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.81 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.81 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  23.28 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  27.84 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  24.47 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  23.47 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  23.67 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  25.75 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  27.4 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  23.13 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.44 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  23.47 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.44 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  23.47 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  23.13 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>