More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1733 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  100 
 
 		 321 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  98.13 
 
 		 321 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  58.41 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  34.08 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  34.08 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  34.08 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  34.08 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  34.08 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  33.76 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  29.28 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  29.08 
 
 		 362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  28.43 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  29.08 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  28.63 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  28.38 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  28.38 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  25.56 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  28.97 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.28 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.24 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.11 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.8 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.67 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  27 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.91 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  26.28 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.55 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25.5 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  25.5 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  25.5 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  25.5 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  25.5 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  25.31 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  25.5 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  25.31 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25.5 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  26.5 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  24.36 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.34 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.11 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.34 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  26.09 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  26.09 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  26.09 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  26.09 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.89 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.89 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  22.67 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  23 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  25.69 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  26.37 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  25.45 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  25.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.44 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  22.48 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  26.09 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  28.08 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  25.95 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3090  PfkB  25.55 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133749  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.67 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  25.56 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  27.76 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  27.76 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  23.94 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  27.1 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  27.1 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  24.21 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  24.12 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.12 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.22 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  27.67 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.83 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  24.76 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.69 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  22.83 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  27.54 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>