More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3974 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  88.31 
 
 		 310 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  85.67 
 
 		 308 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  85.06 
 
 		 308 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  79.55 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  76.32 
 
 		 308 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  75.99 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  76.32 
 
 		 308 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  71.57 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  71.57 
 
 		 314 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  71.57 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  70.92 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  71.24 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  71.75 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  71.43 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  71.75 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  71.24 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  70.92 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  71.43 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  71.75 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  71.24 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  71.24 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  70.49 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  58.63 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  56.23 
 
 		 317 aa  335  5.999999999999999e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  59.08 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  59 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  57.76 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  56.33 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  55.67 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  50 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  47.32 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  47.32 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  47.99 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  47.16 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  47.16 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  47.16 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  49.5 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  46.82 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  45.82 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  46.46 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  45.15 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  45.12 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.56 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.41 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.7 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  45 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.75 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  40.53 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  40.53 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  39.94 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  45.7 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  39.61 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  46.03 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  47.32 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  39.54 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  44.67 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  42.81 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.54 
 
 		 345 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  47.47 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  42.27 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  39.74 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  40.92 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  44.33 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  43.93 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  44.41 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  43.93 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.13 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  40.27 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  40.28 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.33 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.81 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.94 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  43.41 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  44.22 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  47.83 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  42.53 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  37.62 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.44 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  44.33 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  44.33 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  41.75 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  46 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  40.47 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  41.42 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  43.71 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  44 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.08 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.87 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.82 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  42.71 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.9 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  41.75 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  45.36 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  45.36 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  45.36 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  41.39 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.47 
 
 		 403 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>