More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1923 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  68.09 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  67.11 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  70 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  65.78 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  67 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  67.33 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  66 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  68.09 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  61.74 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  61.74 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  61 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  63.21 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  63.21 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  62.88 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  55.7 
 
 		 310 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  64.09 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  55.7 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  62.67 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  62.59 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  55.52 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  63.04 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  63.04 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  56.81 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  56.15 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  54.03 
 
 		 309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  54.03 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  62.59 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  47.32 
 
 		 301 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  51.56 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  52.32 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  51.33 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  51.19 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  51.67 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  51.67 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  47.81 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  51.67 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  48.33 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  43.19 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  48.67 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  42.3 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  42.19 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  40.73 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  43.31 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.4 
 
 		 310 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  46.76 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  41.33 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  44.22 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  43.52 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.82 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  42.86 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  38.96 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  45.07 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  42.72 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.55 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  41.81 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  44.55 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  43.52 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  41.22 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  43.19 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.65 
 
 		 345 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  44.82 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  39.67 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  38.54 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  43.09 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  42.86 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  42.52 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  43.67 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  42.19 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  45.76 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  44.19 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  42.67 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  43 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  44.33 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  43.19 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  44.33 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  43.33 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  39.27 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  43.23 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  43 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  41 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  39.33 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  42.81 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  36.58 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  43.52 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  43.85 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  43.85 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  43.85 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  43.85 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  43.85 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>