65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6216 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  100 
 
 		 304 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  79.67 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  65.68 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  45.82 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  44.74 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  41.18 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  42.54 
 
 		 321 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  28.78 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  24.91 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  34.57 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  27.54 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  33.48 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  36.32 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  28.73 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  22.78 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  28.5 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  32.16 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  24.01 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  24.01 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  31.67 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  27.61 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  20.79 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  21.93 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  50 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  45.1 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.21 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  27.98 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  40.35 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  41.82 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  41.82 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  32.1 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  44 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  40 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  40 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  45.1 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  46 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  24.5 
 
 		 382 aa  42.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  25.55 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>