More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0258 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  766    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  40.5 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  38.12 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  40.33 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  37.02 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  38.9 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  39.34 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  38.78 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  39.06 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  36.09 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  32.47 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  35.69 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  36.67 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  36.67 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  36.67 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  36.33 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  42.37 
 
 		 307 aa  202  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  34.72 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  35.41 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  30 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  30 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.28 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  30.9 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.54 
 
 		 309 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.69 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.97 
 
 		 299 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  29.57 
 
 		 321 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.2 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.57 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.13 
 
 		 308 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.13 
 
 		 308 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.13 
 
 		 308 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.95 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  27.85 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  28.33 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.72 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.77 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  27.08 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  25.68 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  27.08 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.84 
 
 		 307 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.1 
 
 		 307 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  26.12 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.03 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.9 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.59 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  25.21 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25.21 
 
 		 314 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  25.21 
 
 		 309 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25.21 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.69 
 
 		 309 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.59 
 
 		 306 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  24.21 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  23.78 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  24.08 
 
 		 308 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  25.2 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.53 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  26.13 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  24.79 
 
 		 309 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  24.79 
 
 		 309 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  24.79 
 
 		 309 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  24.79 
 
 		 309 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  24.04 
 
 		 309 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  24.79 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  27.68 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  27.76 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  23.53 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  24.56 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  27.54 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.3 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 290 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  25.2 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  25.68 
 
 		 303 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  25.68 
 
 		 303 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.09 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>