More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2170 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  94.27 
 
 		 314 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  59.74 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  45.37 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  34.94 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 363 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 363 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  26.79 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 360 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  27.33 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  27.33 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  27.33 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  27.33 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  26.48 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  26.48 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  25 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  27.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.33 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  27.71 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.77 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.17 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.46 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  25.71 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.43 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.49 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.16 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.9 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  29.57 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  30.38 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  30.38 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  31.85 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29.01 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  30.03 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.96 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  25.23 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.29 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  30.38 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.67 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.51 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.72 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.9 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  28.19 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.78 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  28.42 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  30.77 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  30.63 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.83 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  29.63 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  28.87 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.57 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  29.93 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.21 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  27.12 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  29.39 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.95 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  24.92 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  26.49 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.41 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  24.92 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  24.92 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.15 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  24.92 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  29.11 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  24.92 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.84 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.15 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  24.68 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.15 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.56 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  29.01 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.15 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.15 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>