More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2951 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  85.4 
 
 		 374 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  79.61 
 
 		 363 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  78.24 
 
 		 363 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  43.61 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  43.59 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  37.02 
 
 		 380 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  42.77 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  42.77 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  42.77 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  42.77 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  42.77 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  42.44 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  42.44 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  42.44 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  37.8 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  36.75 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  36.42 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  36.55 
 
 		 306 aa  209  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  38.8 
 
 		 377 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  34.08 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 314 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  29.25 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  27.91 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  26.98 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.58 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.57 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.91 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.84 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.57 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.43 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  29.13 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  29.66 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.74 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  25.17 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  29.21 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.68 
 
 		 307 aa  92.8  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  25.61 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  28.21 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25.95 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  29.06 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  23.79 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.95 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  27.24 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.17 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  27.41 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  27.41 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.61 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  24.92 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.61 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  24.75 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  23.79 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.08 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.77 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  22.06 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  31.47 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  31.47 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.16 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  24.48 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.76 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.76 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  24.58 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1140  ribokinase-like domain-containing protein  23.55 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.3 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  24.59 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.76 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  25.66 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.78 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.97 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.55 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  28.06 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.18 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  25.34 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  23.05 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  26.42 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>