More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1032 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  651    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  58.41 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  58.41 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  40.66 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  37.79 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  37.7 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  34.87 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  34.87 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  34.75 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  34.42 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  34.42 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  34.42 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  34.42 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  34.87 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 380 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  31.77 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  31.44 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  31.44 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 312 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  31.29 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  29.25 
 
 		 377 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.9 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.59 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  22.36 
 
 		 382 aa  92.8  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.19 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  29.32 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.4 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  26.67 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.84 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.84 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  26.67 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.4 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.92 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  26.67 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  26.67 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.84 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  27.46 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.16 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  28.51 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  26.83 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  24.68 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  28.78 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.38 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  25.76 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  24.51 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  23.53 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  23.53 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  22 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  25.49 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  27.41 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  26.16 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  24.32 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  24.52 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  24.15 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  30.88 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  25.67 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.9 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  22.03 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  22.03 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  22.03 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  22.03 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  22.03 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  27.12 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.69 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  26.05 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  26.05 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  22.95 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.38 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.6 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  24.62 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  24.3 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>