More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0358 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  100 
 
 		 377 aa  724    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  55.73 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  37.15 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  35.69 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  35.54 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  36.77 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  37.47 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  36.77 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  36.49 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  39.61 
 
 		 313 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  31.69 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  32.69 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  32.69 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  32.69 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  32.69 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  32.58 
 
 		 313 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  32.26 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  36.25 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  34.09 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  25.96 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  25.64 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  26.02 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  25.4 
 
 		 307 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  24.2 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  33.85 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.99 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 312 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  33.77 
 
 		 313 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.82 
 
 		 309 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.1 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  33.1 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.56 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.33 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  30.07 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  31.06 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  31.06 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.51 
 
 		 305 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  30.24 
 
 		 305 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  31.83 
 
 		 321 aa  86.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  33.98 
 
 		 308 aa  86.3  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  32.99 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.55 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  31.21 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  30.58 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.04 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  31.4 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  29.11 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.3 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  30.42 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  31.35 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  31.4 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  29.9 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.91 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  34.38 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  30.03 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  28.91 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  32.68 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  29.79 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  29.79 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  28.47 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.03 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.03 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.35 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.35 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.24 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.82 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  29.69 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.03 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.93 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.45 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  29.45 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  37.28 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.95 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.61 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.62 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  28.26 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.27 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.39 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.82 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.94 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>