More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1539 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  100 
 
 
320 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  99.69 
 
 
320 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  98.7 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  96.23 
 
 
328 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  75 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  75 
 
 
310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  72 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  75.66 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  61 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  61 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  59.8 
 
 
306 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  61 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  61 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  61 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  61.87 
 
 
309 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  60.93 
 
 
314 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  65.02 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  57.84 
 
 
315 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  57.81 
 
 
315 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  57.81 
 
 
315 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  46.33 
 
 
308 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  45.51 
 
 
308 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.18 
 
 
299 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.56 
 
 
302 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  39.93 
 
 
306 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.25 
 
 
315 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  42.19 
 
 
308 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.06 
 
 
295 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.19 
 
 
311 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.27 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.37 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.94 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.33 
 
 
309 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.96 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.81 
 
 
308 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  43.45 
 
 
308 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  43.6 
 
 
321 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43 
 
 
305 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.25 
 
 
321 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.8 
 
 
345 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.79 
 
 
302 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.46 
 
 
305 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.27 
 
 
302 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.16 
 
 
308 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.77 
 
 
309 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.79 
 
 
302 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  42.41 
 
 
309 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.79 
 
 
302 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.87 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  37.98 
 
 
404 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  43.48 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.67 
 
 
301 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.92 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  43.14 
 
 
311 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  43.14 
 
 
311 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.51 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.41 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  37.06 
 
 
398 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.53 
 
 
297 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.71 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.71 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  36.6 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  38.91 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  39.66 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  44.37 
 
 
310 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  39.31 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  39.31 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  38.97 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  39.31 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  40 
 
 
298 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  38.97 
 
 
298 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.95 
 
 
306 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  38.97 
 
 
298 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  39.31 
 
 
298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  38.62 
 
 
298 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  41.69 
 
 
297 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  33.22 
 
 
305 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.17 
 
 
403 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.74 
 
 
319 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  34.64 
 
 
310 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  34.62 
 
 
404 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  34.62 
 
 
404 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  34.62 
 
 
404 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  37.54 
 
 
302 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  45.67 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  34.62 
 
 
404 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  37.7 
 
 
313 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  34.27 
 
 
404 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  44.93 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  44.93 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.12 
 
 
310 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  35.81 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  35.81 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  31.72 
 
 
308 aa  166  4e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.96 
 
 
305 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  36.84 
 
 
305 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  37.28 
 
 
424 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  39.31 
 
 
298 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.21 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.45 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>