More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1789 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  47.33 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  43.48 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.86 
 
 
307 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  42.05 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  42.28 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  42.19 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  42.62 
 
 
306 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  42.14 
 
 
305 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  41.53 
 
 
305 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.53 
 
 
308 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.6 
 
 
302 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.53 
 
 
315 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.91 
 
 
308 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  41.29 
 
 
317 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.47 
 
 
302 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  40.13 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  40 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  40.13 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.12 
 
 
345 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  39.74 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.06 
 
 
299 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.27 
 
 
312 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.85 
 
 
319 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.26 
 
 
304 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.27 
 
 
302 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  39.6 
 
 
310 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.85 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.79 
 
 
301 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  40.07 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  38.26 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  38.26 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  36.63 
 
 
316 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.92 
 
 
303 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.26 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.8 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  39.46 
 
 
305 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  39.33 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.33 
 
 
403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  42.57 
 
 
299 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  37.75 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  39.8 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.81 
 
 
313 aa  178  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  37.54 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.4 
 
 
295 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.12 
 
 
308 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  39.19 
 
 
321 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.16 
 
 
308 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  37.46 
 
 
305 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  36.79 
 
 
308 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.16 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.16 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.39 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  38.11 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  38.85 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  38.13 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  35 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  35 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  37.21 
 
 
306 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  38.59 
 
 
303 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  38.59 
 
 
303 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.93 
 
 
314 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  40.86 
 
 
306 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.21 
 
 
318 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  35.37 
 
 
290 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  37.58 
 
 
303 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  39.26 
 
 
326 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.67 
 
 
307 aa  169  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.5 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  37.25 
 
 
303 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  37.33 
 
 
305 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  39.25 
 
 
302 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.54 
 
 
311 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.54 
 
 
311 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  39.27 
 
 
307 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.02 
 
 
307 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  39.67 
 
 
334 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.57 
 
 
291 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  37.54 
 
 
311 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.25 
 
 
303 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.25 
 
 
303 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.65 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35.35 
 
 
340 aa  166  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  34.58 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.79 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.75 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  37.79 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  37.12 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  38.08 
 
 
323 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.41 
 
 
306 aa  162  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  39 
 
 
293 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  32.55 
 
 
303 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.96 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  36.96 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.96 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>