More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0162 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  43.36 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  43.93 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  46.46 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  44.98 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  46.62 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.52 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.53 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.67 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.66 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.69 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.67 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.81 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  46.18 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  41.12 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.44 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  40.82 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.67 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.47 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  43.83 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.58 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  42.24 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.67 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  40.48 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.93 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  42.09 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  41.91 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  40.6 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  38.59 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  43.61 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  41.91 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  41.91 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  41.91 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  44.26 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  39.06 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  44.26 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.53 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  41.14 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  40.2 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.66 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.92 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.81 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  43.38 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  44.59 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  40.52 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  40.6 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  40.6 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  41.06 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  44.26 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  44.26 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  43.61 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.26 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.06 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  43.61 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.73 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  44.26 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  41.25 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  41.08 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  43.93 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.14 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  40.6 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  43.61 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  41.58 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  42.05 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  41.58 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  40.59 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.93 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  42.57 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  41.23 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.06 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.66 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  41.25 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  40.92 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  40.92 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  37.01 
 
 		 340 aa  212  7e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  40.46 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  39.07 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  39.07 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  40.19 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  38.74 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  38.74 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  38.87 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  43.96 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.6 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  40.85 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  36.18 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.2 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  41.58 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  37.75 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  36.21 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  40.85 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.67 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.67 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  41.25 
 
 		 303 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  41.81 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.54 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  36.09 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  41.47 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>