More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2838 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  100 
 
 
314 aa  633  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  71.34 
 
 
315 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  67.76 
 
 
309 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  70.68 
 
 
315 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  70.68 
 
 
315 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  60.93 
 
 
320 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  61.26 
 
 
320 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  58.19 
 
 
306 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  61.59 
 
 
328 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  58.19 
 
 
306 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  58.19 
 
 
306 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  58.19 
 
 
306 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  58.19 
 
 
306 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  61.13 
 
 
308 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  59.8 
 
 
310 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  57.81 
 
 
310 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  58.19 
 
 
310 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  57.81 
 
 
344 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  52.82 
 
 
306 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  56.67 
 
 
308 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  42.52 
 
 
308 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.74 
 
 
311 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  41.23 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.53 
 
 
308 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.78 
 
 
306 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40 
 
 
310 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.94 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  41.61 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.13 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.61 
 
 
301 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  41.92 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.63 
 
 
304 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.71 
 
 
302 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  42.37 
 
 
302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  36.96 
 
 
302 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.23 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  41.64 
 
 
295 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.46 
 
 
302 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  40.61 
 
 
307 aa  186  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  36.39 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  39.93 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.21 
 
 
345 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.93 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  41.42 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  39.93 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05890  sugar kinase, ribokinase  42.43 
 
 
309 aa  178  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.93 
 
 
308 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  38.18 
 
 
316 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39 
 
 
309 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.25 
 
 
299 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  38.03 
 
 
305 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.54 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.5 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.33 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  35.95 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  35.95 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  35.95 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.09 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.16 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.16 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.21 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.21 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.21 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.21 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  41.28 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.95 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.44 
 
 
307 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35.22 
 
 
303 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  38.72 
 
 
315 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.87 
 
 
309 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  41.28 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  41.28 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.05 
 
 
306 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.61 
 
 
298 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.09 
 
 
307 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  36.51 
 
 
305 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.53 
 
 
317 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.83 
 
 
295 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  35.29 
 
 
307 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37 
 
 
310 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  40.62 
 
 
291 aa  169  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.25 
 
 
309 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  39.39 
 
 
297 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  39.26 
 
 
311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  41.83 
 
 
301 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  35.33 
 
 
303 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  35.33 
 
 
303 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  39.26 
 
 
311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  36.11 
 
 
298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.25 
 
 
314 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.25 
 
 
314 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.25 
 
 
309 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.71 
 
 
403 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.46 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  35.35 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>