More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02054 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  100 
 
 
313 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  98.72 
 
 
313 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  98.4 
 
 
313 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  99.04 
 
 
313 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  98.72 
 
 
313 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  43.41 
 
 
374 aa  265  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 
363 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 
363 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  39.74 
 
 
362 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  39.41 
 
 
362 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  39.41 
 
 
362 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  39.41 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 
360 aa  219  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  35.76 
 
 
363 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  34.08 
 
 
321 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
380 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  34.3 
 
 
321 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  34.42 
 
 
318 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  33.94 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 
314 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 
314 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  30.43 
 
 
315 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  34.05 
 
 
369 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  33.01 
 
 
377 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  30.9 
 
 
313 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  27.8 
 
 
382 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  27.27 
 
 
314 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  28.08 
 
 
316 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  25.52 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.52 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25.17 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  27.33 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  25.88 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.58 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  23.86 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  23.83 
 
 
304 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.17 
 
 
308 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  24.57 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.91 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  27.7 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.73 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  27.53 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02430  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
759 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.73 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.73 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.06 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  24.65 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.09 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.21 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  25.33 
 
 
404 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.61 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  25.97 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  25.97 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.28 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  25.97 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.08 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  26.35 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  23.67 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.21 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.41 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  25.97 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  23.83 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.48 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  27.13 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.39 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  25.41 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  25.4 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  28.41 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  22.41 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  23.21 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  29.1 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.08 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  23.63 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  23.21 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  23.97 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  23.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  23.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  25.11 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  23.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  23.21 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.47 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  23.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.86 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  23.21 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  27.92 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>